Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms