Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms