Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms