Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS8Q8N3P4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms