Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms