Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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C9orf40Q8IXQ3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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C9orf40Q8IXQ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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C9orf40Q8IXQ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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C9orf40Q8IXQ3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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C9orf40Q8IXQ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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C9orf40Q8IXQ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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C9orf40Q8IXQ3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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