Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms