Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms