Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A3Q7Z3Q1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC46A3Q7Z3Q1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms