Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms