Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MICAL3Q7RTP6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms