Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HECW1Q76N89 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HECW1Q76N89 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.51■■■□□ 2
HECW1Q76N89 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms