Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSH2Q76I76 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms