Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms