Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TREML4Q6UXN2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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