Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
METAP1DQ6UB28 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
METAP1DQ6UB28 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms