Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A10Q6U841 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms