Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms