Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBC1D3CQ6IPX1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBC1D3CQ6IPX1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBC1D3CQ6IPX1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBC1D3CQ6IPX1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBC1D3CQ6IPX1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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