Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms