Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGAP9Q5VTM2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms