Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C10orf55Q5SWW7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms