Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DCAF6Q58WW2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DCAF6Q58WW2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DCAF6Q58WW2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DCAF6Q58WW2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DCAF6Q58WW2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms