Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms