Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms