Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms