Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms