Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HFEQ30201 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms