Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms