Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KNOP1Q1ED39 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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