Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GEN1Q17RS7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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