Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PFKFB3Q16875 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PFKFB3Q16875 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms