Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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