Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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PDK4Q16654 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PDK4Q16654 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PDK4Q16654 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PDK4Q16654 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PDK4Q16654 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PDK4Q16654 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PDK4Q16654 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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