Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms