Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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