Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK5Q16478 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK5Q16478 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK5Q16478 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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