Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF2Q15853 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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