Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms