Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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