Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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RABEP1Q15276 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RABEP1Q15276 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RABEP1Q15276 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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