Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRKQ15262 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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