Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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PTPAQ15257 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PTPAQ15257 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTPAQ15257 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPAQ15257 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPAQ15257 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPAQ15257 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPAQ15257 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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