Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms