Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NECTIN1Q15223 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NECTIN1Q15223 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NECTIN1Q15223 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NECTIN1Q15223 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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