Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5R1Q15078 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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CDK5R1Q15078 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDK5R1Q15078 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDK5R1Q15078 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDK5R1Q15078 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDK5R1Q15078 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDK5R1Q15078 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R1Q15078 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms