Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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