Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GAPVD1Q14C86 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms