Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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GPNMBQ14956 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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