Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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